Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms