Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms