Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms