Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms