Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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