Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Mfsd13aQ6PDE8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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