Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AtminQ6P9S1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms