Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4Q6P1D7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms