Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms