Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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