Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms