Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms