Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit1Q64282 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit1Q64282 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms