Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms