Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms