Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
JrkQ60976 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms