Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms