Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm1Q60636 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms