Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms