Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms