Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms