Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3UPC7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms