Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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