Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UJP5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms