Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec24aQ3U2P1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec24aQ3U2P1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms