Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms