Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21440Q3TTD8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms