Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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