Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pglyrp4Q0VB07 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms