Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms