Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms