Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms