Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms