Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2aQ01320 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms