Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms