Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited1P97769 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms