Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas2P97460 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas2P97460 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms