Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms