Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43cP86449 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms