Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms