Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms