Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb13P70321 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms