Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms