Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms