Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps5P59438 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms