Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Cux1P53564 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux1P53564 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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