Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TspoP50637 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TspoP50637 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TspoP50637 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TspoP50637 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TspoP50637 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TspoP50637 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TspoP50637 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TspoP50637 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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