Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms