Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms