Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax9P47242 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms